壓縮機系統是凍干機核心系統，它的平衡是否決定凍干制品的質量，而且，壓縮機系統平衡運轉是很關鍵的。壓縮機系統由于使用條件比較嚴酷和發生長時間運轉，運轉中的振動及冷熱膨脹等原因會導致發生壓縮機效果不當、系統外泄等故障，影響藥品凍干效果，及時處理對壓縮機系統展開保護保養顯得很重要。凍干機壓縮機系統的保護保養也不是隨隨意便的，是須要注意下列事項的！
　　1.只要具備專業知識的人員才能對壓縮機系統展開保護保養和修理工作。
　　2.壓縮機系統電氣部件具備高電壓，而且，在對凍干機壓縮機系統展開保護或修理時，首先應阻斷電源。
　　3.撥打電源后，電源開關處在撥打狀態，即使是不操作方式設備，壓縮機也有可能會即時啟動廢舊壓縮機劑。
　　4.壓縮機系統高壓部分的溫度，假如達到100℃以上，很大要防治燒傷，壓縮機系統擾動部分低溫達-70℃下列，防治灼傷。
　　5.壓縮機系統的壓縮機劑對大氣會產生很大的污染，不能隨意排放量。排放量壓縮機劑的時候，請從壓縮機系統的高壓部分開始，并保證水冷凝器冷卻水處在流動狀態，防治水冷發生阻滯的情況。
　　6.壓縮機劑填入和排放量的時候，不要在密封環境及氨氣中展開操作方式，防止窒息而死和中毒。
　　7.壓縮機劑填入和排放量佩戴好個人防水，小心操作方式，防止液態壓縮機劑灼熱眼睛或者皮膚，假如一旦灼熱我們的眼鏡或皮膚上，很大要及時處理沖洗掉，嚴重的話及時處理看病。
　　8.壓縮機系統帶壓狀況嚴禁對壓縮機系統施焊或拆除部件。
　　9.壓縮機系統的冷凍機油處理須要參考當地的環保要求。